データ分析でRを使うことが増えたのでメモ

Rの癖

大体の感じ

• コマンドライン型のツール
• データを読み込ませてコマンドで数学的な処理ができる
• 結果はグラフに表示したり数式で表示したり。
• パッケージを追加インストールするとできることが増える
  • パッケージをインストールする時はrootでRを起動する(/usr/libにインストールしてくれる)

インストールと起動

$ sudo apt install r-base ←インストール

$ R　←起動

CSVから3dグラフを作る

パッケージをインストール

> install.packages("rgl") 
  3D処理が得意なパッケージ
> install.packages("scatterplot3d")
  色を付けたりするのが得意な3Dパッケージ

CSVデータを読み込む

注意点

• 先頭列にも列名を付けること
• 列名は英数字にすること
• 列数は3つ以上あっても大丈夫

変数Dにa.csvの中身を読み込む
> D <- read.table("./a.csv",header=TRUE,sep=",",na.strings="NA",dec=".");
　sep : セパレータ。普通は,
  na.strings :　NAという文字を空白として扱う
  dec : 小数点。普通は.

x,y,z軸を指定して3Dグラフを書く
> library(rgl)
> plot3d(x=D$M5, y=D$M25, z=D$FST)
  DのM5列はD$M5と表現する
→ 3Dグラフが表示される